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python之使用python生成petsc二进制文件

2023年11月22日15Free-Thinker

我正在尝试使用 python 创建一个 PETSC 二进制文件。我尝试在 bash shell 上运行脚本,但出现错误

$ python -c 'print file.shape\n import sys,os\n sys.path.append(os.path.join(os.environ['PETSC_DIR'],'bin','pythonscripts '))\nimport PetscBinaryIO\nio=PetscBinaryIO.PetscBinaryIO()\nfile_fortran=file.transpose((2,1,0))\n io.writeBinaryFile('my_geometry.dat',(walls_fortran.rave1()).view (PetscBinaryIO.Vec),))'

Unexpected character after line continuation character. 

我知道这是因为有一个额外的 \ 但我的代码似乎没有。我尝试以交互方式运行 python,以使用 python -i 查找代码的哪一部分有问题

>>> walls=open('file.dat','r+') 
>>> print walls.shape() 
Traceback (most recent call last): 
  File "<stdin>", line 1, in <module> 
AttributeError: 'file' object has no attribute 'shape' 

我是 python 的新手,所以我知道这可能是一个明显的错误。但我似乎不知道这是关于什么的

感谢约翰的回答。 现在它识别出 PETSC_DIR 我得到了错误

 >>> PETSC_DIR="/home/petsc-3.4.3" 
 >>> sys.path.append(os.path.join(os.environ["PETSC_DIR"],"bin","pythonscripts")) 
 
     Traceback (most recent call last): 
     File "<stdin>", line 1, in <module> 
     File "/usr/lib64/python2.6/UserDict.py", line 22, in __getitem__ 
     raise KeyError(key) 
     KeyError: 'PETSC_DIR'</code> 

它不识别 PETSC_DIR,即使我指定了它

请您参考如下方法:

为了便于说明,让我们摘录该 bash 脚本的一小段:

python -c 'print file.shape\n import sys,os\n' 

在 bash 单引号字符串中,正如您在此处所用,字符“\n”表示反斜杠后跟“n”。 Python 将此视为“额外的反斜杠”,即使您的意思是将“\n”解释为换行符。这就是产生类型错误的原因

unexpected character after line continuation character 

要解决此问题,请尝试:

python -c $'print file.shape\n import sys,os\n' 

Bash 特殊对待 $'...' 字符串,除其他事项外,会将 \n 序列替换为 python 能够理解并知道如何处理的换行符过程。

(上面的代码仍然会报错,因为 file 没有 shape 属性。下面会详细介绍。)

还有其他问题。以这段摘录为例:

python -c 'sys.path.append(os.path.join(os.environ['PETSC_DIR'],'bin','pythonscripts'))' 

在 bash 删除引号后,python 看到:

sys.path.append(os.path.join(os.environ[PETSC_DIR],bin,pythonscripts)) 

这行不通,因为 python 需要 PETSC_DIRbin 以及 pythonscripts 被引用(使用单引号或双引号:python不在乎)。试试看:

python -c 'sys.path.append(os.path.join(os.environ["PETSC_DIR"],"bin","pythonscripts"))'

当 bash 看到单引号内有双引号时,它不会管它们。因此,python 将在需要的地方接收带引号的字符串。

总之,在我看来错误不是由您的 python 代码引起的,而是由 bash 在将它传递给 python 之前对您的 python 代码所做的操作引起的。

附录:至于 print walls.shape() 错误,其中 walls 是文件句柄,错误的意思是:文件句柄没有 shape 属性。可能您想使用 os.path.getsize(path) os.path 模块中的函数以字节为单位获取文件大小?